Grâce à l'évacuation quotidienne des excréments (donc également des granulés souillés) et au brassage des granulés dans le bac supérieur, les granulés ne doivent être que complétés et ne sont en principe pas remplacés. Sauf dans des situations exceptionnelles, comme la diarrhée.
Le bac inférieur doit être vidé environ une fois par semaine, ou plus souvent s'il y a plusieurs chats dans la maison ou si le bac inférieur est rempli de sciure de bois. Si le bac inférieur est trop plein, le système ne fonctionnera plus et la saleté restera dans le bac supérieur, ce qui provoquera des mauvaises odeurs.
Vous pouvez nettoyer le bac inférieur avec un chiffon doux et une solution savonneuse non agressive ou de l'eau chaude additionnée de vinaigre ou de bicarbonate de soude. Un simple rinçage sous le robinet est également suffisant. N'utilisez pas d’éponge à récurer ou de matériaux abrasifs contenant du sable. Ceux-ci provoquent de minuscules rayures. Ils forment un foyer pour les bactéries et peuvent entraîner des mauvaises odeurs.